原理简介
GFP、RFP等荧光蛋白因其的荧光性质和灵敏性,常作为报告基因研究并分析基因产物在细胞中的定位和相互作用等。将目标蛋白与荧光蛋白的N端或者C端融合,通过瞬时转化技术或稳定遗传转化技术,使得该融合蛋白在受体材料细胞内表达,目标蛋白会牵引荧光蛋白一起定位到目标细胞器,通过显微镜观察荧光蛋白在细胞内显示的位置,确定目标蛋白的位置,从而确定目标蛋白的亚细胞定位情况。
为什么有的基因定位结果与预想的不一致?
对于一个特定的定位载体,只要荧光表达较好,其定位结果是确定的,不会随人为意愿或操作而改变。至于有时候和预想的结果不一样,可能和蛋白本身、选择的表达载体以及荧光蛋白融合方式等有关。
为什么有的普通定位结果出来后无法准确判断其定位位置?
细胞中的细胞器复杂且多样,除一些常见的、特征比较明显的细胞器外,有些细胞器在激光共聚焦下形状比较相似,例如:线粒体、过氧化物酶体、高尔基体等细胞器,它们的荧光表达形状可能都是点状,因此不易区分。这时可以结合基因的其他功能研究来判断其可能表达的位置。另外,蛋白表达本身也是一个复杂的过程,涉及到多个合成场所及转运过程,自身表达情况可能比较复杂,因此不易判断具体的表达位置。
亚细胞结构分离定位法
通过离心等技术分离各亚细胞结构,然后从分离物种进一步提取蛋白质,对目标蛋白质进行分析或检测,从而获得目标蛋白的定位。本方法适合研究某蛋白质组级别的细胞器定位,通常与双向凝胶电泳分离和质谱技术相结合。
生物信息学预测
通过生物信息学手段,借助一些在线工具对蛋白的亚细胞定位信息进行预测,这种方法可以在短时间获得大量蛋白的预测信息,不仅辅助于实验,还能省时省力节约成本。