亚细胞定位操作步骤
1、通过一些在线网站预测亚细胞定位
2、亚细胞定位载体构建
(1)引物设计:利用引物设计软件,根据pEGP-MCS-N1或pEGP-C1-MCS的酶切位点设计目的基因引物。
(2)载体构建:将PCR产物酶切后插入pEGP-MCS-N1或pEF-C1-MCS,得到表达目的基因与EGP融合蛋白质的真核表达载体。
3、细胞转染
当细胞生长到对数生长期时,接种到共聚焦显微镜的玻璃底培养皿(35mm petri dish,10 mm Microwell)中,培养过夜。当细胞贴壁率达到30%~50%时,将融合绿色荧光蛋白GFP的重组载体质粒和目标细胞器质粒共转染细胞。37℃孵箱培养24~72h。
4、激光扫描共聚焦显微镜观察
将上述细胞分别在24、36、48、72h的时间点,根据实验需求选择对应激发波长(常用405nm、488nm和561nm),使用共聚焦显微镜观察,采取图像。
为什么不先对基因做预测,在预测的结果上直接做共定位?
不同的预测网站有不同的计算方法,同一个基因在不同的预测网站也可能得出不同的定位结果。另外所有的结果都应是基于实验得到的,对于不清楚可能定位在哪里的基因,一般推荐先做普通定位,根据普通定位的结果再决定做哪种细胞器的共定位。
适用于什么实验场景?
(1)基因功能研究,文章里总少不了这一项。
(2)研究蛋白相互作用,与酵母双杂实验结果相互验证。
启动子筛选:寻找基因表达的关键调控元件
基因表达的调控是一个复杂的过程,其中关键的环节之一就是转录的启动子。转录是生物体内基因表达的重要步骤,而转录的启动子则是这一过程的关键调控元件。因此,启动子的筛选对于理解基因表达的调控机制以及疾病的等方面都具有重要的意义。
启动子的筛选通常是通过生物信息学的方法进行的。首先,通过基因组测序和生物信息学分析,可以确定基因的启动子区域,这一区域通常位于基因编码区的上游。然后,通过各种预测算法,可以分析启动子区域内的DNA序列,以确定是否存在转录因子的结合位点。这些转录因子通常是蛋白质,它们可以与DNA序列结合,从而影响转录的效率和程度。