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内质网

内质网是细胞中的一个复杂网络，它负责合成和转运蛋白质。为了定位内质网，我们可以使用一种名为GFP-HDEL的蛋白质来标记它们。GFP-HDEL是一种带有绿色荧光的蛋白质，它可以与内质网上的HDEL序列结合。在洋葱细胞中，内质网通常位于细胞的中央或周围。

高尔基体

高尔基体是细胞中的另一个复杂网络，它负责合成和转运蛋白质。为了定位高尔基体，我们可以使用一种名为FM4-64的化合物来标记它们。FM4-64可以穿过细胞膜并进入高尔基体，从而发出红色荧光。在洋葱细胞中高尔基体通常位于细胞的中央或周围。

亚细胞定位操作步骤

1、通过一些在线网站预测亚细胞定位

2、亚细胞定位载体构建

（1）引物设计：利用引物设计软件，根据pEGP-MCS-N1或pEGP-C1-MCS的酶切位点设计目的基因引物。

（2）载体构建：将PCR产物酶切后插入pEGP-MCS-N1或pEF-C1-MCS，得到表达目的基因与EGP融合蛋白质的真核表达载体。

3、细胞转染

当细胞生长到对数生长期时，接种到共聚焦显微镜的玻璃底培养皿（35mm petri dish，10 mm Microwell）中，培养过夜。当细胞贴壁率达到30%~50%时，将融合绿色荧光蛋白GFP的重组载体质粒和目标细胞器质粒共转染细胞。37℃孵箱培养24~72h。

4、激光扫描共聚焦显微镜观察

将上述细胞分别在24、36、48、72h的时间点，根据实验需求选择对应激发波长（常用405nm、488nm和561nm），使用共聚焦显微镜观察，采取图像。

蛋白质亚细胞定位的研究方法

1、融合报告基因定位法

将绿色荧光蛋白（GFP）及其衍生蛋白、β-葡萄糖苷酸酶（GUS）等报告基因，与目标蛋白基因融合在一起，由目标蛋白的引导信号进行亚细胞定位，对报告蛋白的光信号进行跟踪和观察，从而确定目标蛋白的定位。该方法是目前使用广泛的蛋白质亚细胞定位研究方法。

2、荧光标记定位法

将反应与化学光学信号相结合，通过特异性的荧光标记与目标蛋白（抗原）结合，通过荧光信号检测，确定目标蛋白的亚细胞位置。目前标记信号不局限于荧光素，还有同位素、酶、胶体金颗粒、纳米金属颗粒等。